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　　泛素结合结构域（ubiquitin-binding domains，UBD）是一种可识别和结合泛素化修饰的蛋白小模块。根据结构域的不同可将UBD分为20个家族，这些UBD对泛素的亲和力不等（2~500umol），且存在泛素链的偏好性。UBD结合下的泛素化蛋白在胰蛋白酶的作用下，泛素化底物上的泛素化位点Lys由于泛素化产生一个带2个甘氨酸标签的分枝状漏切肽段，这2个甘氨酸标签是由于修饰的泛素分子的C末端通过异肽键与泛素化位点的Lys结合，经过胰蛋白酶消化后保留的残基。产生的信号肽在质谱信号中会产生一个114.043Da的质量跃迁，结合漏切的Lys位点，合称为GG-K信号肽，通过该信号肽结合数据库搜索引擎可实现对泛素化底物的鉴定。这也是高精度质谱技术实现泛素化底物鉴定的基础。